El Gigante de Luz, Ultraman, salvó el planeta de la amenaza alienígena, y el humano con quien se fusionó, Shin Hayata, regresó a su vida normal tras perder sus recuerdos al respecto; no obstante, su hijo Shinjiro hereda sus poderes gracias al Factor Genético de Ultraman.
Muchos años han pasado; un antiguo enemigo busca a Shinjiro para asesinarlo antes de que sus poderes maduren, pero Shin lo impide, enfrascándose en una batalla que no puede ganar. Es entonces cuando su hijo decide salvarlo con la ayuda de un nuevo traje clase Ultraman, diseñado específicamente para él…